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Bayes Linuxでバイオインフォマティクス解析環境を簡単に再現良く構築する

1. はじめに Bayes (Bioinformatics AnalYsis Environment System, ベイズ) Linux は国立研究開発法人理化学研究所 情報基盤センター バイオインフォマティクス研究開発ユニット (RIKEN ACCC BiT) で開発されているバイオインフォ解析環境込みのLinuxディストリビューションです。このディストリビューションには、データ解析パイプラインシステム Galaxy や超並列単鎖D […]

Laravel5.5(HomeStead) x PHP7.2 x Vagrant x ShellScript(jq) で艦これセリフAPI的なのを作ったよ!

(この記事は Livesense – 関 Advent Calendar 2017 掲載のために書かれています) 5日目担当の @chobitsky です。 なにげにQiitaでは初投稿となります、よろしくお願いします。 今年のリブセンスのアドベントカレンダーは3種類のテーマがあり、そのうちの「関」に参加させてもらいました。 関といえば? 大体の人が関数とか関連とか関係性とか選ぶと思うので、僕も「関心」があるものとして大好き […]

Vagrant による EC2 のプロビジョニング + Jupyter(IPython Notebook)on Docker

概要 (前半)Vagrantを利用してのEC2のプロビジョニング (後半)Dockerを利用してのJupyter(IPython Notebook)の起動 初めてQiitaに書かせていただきます。 正月休みにゼロから学ぶディープラーニングと、あわよくばTensorFlowを勉強しよう、せっかくなら環境構築も勉強しよう……と試してみたので、備忘録兼ねての紹介です。 今回前後半は独立しているので片方のみの参照も可能かと思います。 🙂 EC2 […]

機械学習を始めてみたい Windows ユーザーにお勧めする環境構成

はじめに Windows で機械学習を始めてみたい場合、選択肢としては Windows に直接、ツール群をインストールする 仮想環境を立てて、その上に環境構築する のどちらかになるわけですが、僕は後者一択だと思います。 直接 Windows に python 含め各ツール群を入れるのは僕はお勧めしません。理由は メイン PC は綺麗に使いたい。Windows をメイン PC として使っている方は多いと思いますが、そこにツールをごちゃごち […]

TensorFlow環境をWindows10 + Vagrant + VirtualBox + Ubuntu + Dockerで構築して触ってみる

概要 TensorFlowを勉強するために環境を構築した時の記録。 環境はタイトルにある通り、 Windows10 Home 64bit Vagrant VirtualBox Ubuntu 16.04 LTS 64bit Docker TensorFlow CPU Only Vagrant で Ubuntu 起動 とりあえず Vagrant で Ubuntu の環境を起動しようとしたものの、エラー(404 Not Found)が発生した […]

CentOS7にTensorFlowをインストールする

※この記事は、2016年8月に他のブログで書いた記事をQiitaに移行したものです。 色々あって、ディープラーニングの勉強を始めることになりました。といっても、TensorFlow(Googleのディープラーニングフレームワーク)を動かしてみるのが、目先の目標です。 本格的にやるなら、高度な数学の知識も必要そうだし、どうしようかなーというところです。 やりたいことが多すぎて、優先順位づけが難しいですね。 早速、環境を整えたので、その際の […]

Vagrant Tips#7 Javaのビルド環境としてmaven3の環境をセットアップする

Vagrant Tipsのサマリページはこちら この記事のサマリ この記事に記載されたscriptを利用することで、さくっとmavenを触ってみることができるようになります。 対象読者 mavenって聞いたことあって、触れてみたいけど、環境構築が面倒だなぁという方 動作確認バージョン vagrant versionの結果 Installed Version: 1.7.4 経緯 mavenの勉強をしておきたいなぁと思ったのです。 mave […]

Vagrant Tips#2 Oracleのjdk(1.7系)をインストールさせる

Vagrant Tipsのサマリページはこちら この記事のサマリ vagrant upしたら、jdk1.7系を自動的にダウンロードして、そのままjavaが使える環境が出来上がります。 対象読者 java(7系)のsandbox環境が欲しい方 動作確認バージョン vagrant version Installed Version: 1.7.4 経緯 さくっと利用できるjavaのsandbox環境が欲しかったので。 Oracleのjdkをイ […]

Vagrant Tips#2’ Oracleのjdkをインストールさせる(jdk8系)

Vagrant Tipsのサマリページはこちら Vagrant Tips#2 Oracleのjdkをインストールさせる のjava8版です。2015年の4月でjdk7のサポートが終了になるとのことなので、そろそろjava8をまじめに勉強しようと思います。 Vagrantfile Vagrant::Config.run do |config| config.vm.box = "centos64_6_5" config.vm.box_url […]

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